694 sayılı KHK ile personel ihraçları, işe iadeler ve bazı kurumların kapatılmasının yanı sıra, bir dizi temel düzenleme de yapıldı.
Yeni KHK'ye göre Başbakanlığa bağlı olan MİT Cumhurbaşkanlığına bağlandı. Yeni KHK ile Cumhurbaşkanılığı bünyesinde Milli İstihbarat Koordinasyon Kurulu kuruldu. Devletin çıkarlarının veya görevin gizliliğinin zorunlu kıldığı hallerde MİT mensuplarının, MİT'te görev yapmış olanların tanıklığı MİT Müsteşarına, MİT Müsteşarının tanıklığı ise Cumhurbaşkanının iznine bağlandı.
694 sayılı KHK’de; milletvekillerine seçimler öncesinde ya da sonrasında işlediği suçlardan soruşturma açılabilmesinin önü açıldı.
KHK’lar ile ayrıca Emniyet Genel Müdürlüğü’ne 29 bin, Özel Harekat’a 3 bin 4 kişilik kadro tahsis edilirken, 4 bin de yeni hakim ve savcı alınacağı bildirildi.