Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan, Mavi Marmara'yı örgütleyenlere "Bizden izin aldınız da mı yaptınız?" dedi. 2014 yılında ise Gülen cemaatine saldırırken otorite olarak izin verdiklerini söylemişti.
Yenikapı Şehir Parkı'nda İstanbul Dostluk Derneği'nce düzenlenen iftarda konuşan Erdoğan, İHH'ya yönelik bir saldırıya Gülen cemaatinin destek verdiği iddiasından yola çıkarak şunları söylemişti:
"Pensilvanya'nın bu kuruluşa olan kini bu yardım kuruluşunun İsrail'e verdiği rahatsızlıktan dolayı. Pensilvanya'nın İsrail'e karşı bir açıklamasını duydunuz mu, duyamazsınız. İsrail'in Mavi Marmara'dan dolayı bu yardım teşkilatına kini var. Pensilvanya'nın da aynı sebeple bu kuruluşa kini var. Ne diyordu, otoriteden izin alman lazım. Otorite kim? Güneydeki sevdikleri mi, yoksa biz mi? Eğer otorite Türkiye' de bizsek, biz zaten izni verdik. Ama onlara göre İsrail."